MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus BB22OP chromosome 1

Total Repeats: 53173

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019955	GCA	2	6	408	413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656323
2	NC_019955	TCT	2	6	414	419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
3	NC_019955	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	433656323
4	NC_019955	TCT	2	6	480	485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656323
5	NC_019955	TGC	2	6	596	601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656323
6	NC_019955	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	433656323
7	NC_019955	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	433656323
8	NC_019955	CAC	2	6	769	774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656323
9	NC_019955	TAA	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656323
10	NC_019955	ATT	2	6	909	914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656324
11	NC_019955	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	433656324
12	NC_019955	GTC	2	6	952	957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
13	NC_019955	TGC	2	6	989	994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
14	NC_019955	GCT	2	6	1047	1052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
15	NC_019955	GAC	2	6	1101	1106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
16	NC_019955	GC	3	6	1108	1113	0 %	0 %	50 %	50 %	433656324
17	NC_019955	GGT	2	6	1161	1166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656324
18	NC_019955	TTG	2	6	1268	1273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656324
19	NC_019955	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	433656324
20	NC_019955	CCA	2	6	1365	1370	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
21	NC_019955	T	6	6	1425	1430	0 %	100 %	0 %	0 %	433656324
22	NC_019955	TCA	2	6	1436	1441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656324
23	NC_019955	CAG	2	6	1458	1463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
24	NC_019955	GAT	2	6	1468	1473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
25	NC_019955	GCA	2	6	1509	1514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
26	NC_019955	GAC	2	6	1602	1607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656324
27	NC_019955	CTT	2	6	1656	1661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
28	NC_019955	GAT	2	6	1684	1689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656324
29	NC_019955	TCT	2	6	1736	1741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656324
30	NC_019955	CCA	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
31	NC_019955	TGC	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
32	NC_019955	GCT	2	6	1853	1858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
33	NC_019955	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	433656324
34	NC_019955	GCT	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656324
35	NC_019955	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	433656324
36	NC_019955	AAT	2	6	2209	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656324
37	NC_019955	ACC	2	6	2221	2226	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656324
38	NC_019955	GT	3	6	2395	2400	0 %	50 %	50 %	0 %	433656325
39	NC_019955	T	6	6	2406	2411	0 %	100 %	0 %	0 %	433656325
40	NC_019955	ACCA	2	8	2464	2471	50 %	0 %	0 %	50 %	433656325
41	NC_019955	GAA	2	6	2493	2498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
42	NC_019955	AAG	4	12	2500	2511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
43	NC_019955	TCT	2	6	2540	2545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
44	NC_019955	GTT	2	6	2566	2571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
45	NC_019955	TCT	2	6	2579	2584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
46	NC_019955	AGT	2	6	2611	2616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
47	NC_019955	GTA	2	6	2625	2630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
48	NC_019955	GAA	2	6	2664	2669	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656325
49	NC_019955	CTTTCT	2	12	2771	2782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656325
50	NC_019955	CAT	2	6	2793	2798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
51	NC_019955	GTC	2	6	2820	2825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
52	NC_019955	CAC	2	6	2918	2923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
53	NC_019955	GAT	2	6	2943	2948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
54	NC_019955	AGCA	2	8	2985	2992	50 %	0 %	25 %	25 %	433656325
55	NC_019955	GTGA	2	8	2993	3000	25 %	25 %	50 %	0 %	433656325
56	NC_019955	AGCC	2	8	3022	3029	25 %	0 %	25 %	50 %	433656325
57	NC_019955	CTAGGT	2	12	3041	3052	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656325
58	NC_019955	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
59	NC_019955	TTG	2	6	3075	3080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
60	NC_019955	TACG	2	8	3152	3159	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
61	NC_019955	AGC	2	6	3228	3233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
62	NC_019955	AGT	2	6	3239	3244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
63	NC_019955	TGC	2	6	3255	3260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
64	NC_019955	T	6	6	3324	3329	0 %	100 %	0 %	0 %	433656325
65	NC_019955	ACC	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
66	NC_019955	GTT	2	6	3441	3446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
67	NC_019955	GTT	2	6	3453	3458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
68	NC_019955	GCT	2	6	3624	3629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
69	NC_019955	CAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656325
70	NC_019955	TGA	2	6	3676	3681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
71	NC_019955	TGA	2	6	3714	3719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656325
72	NC_019955	CAG	2	6	3728	3733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656325
73	NC_019955	CCA	2	6	3766	3771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656325
74	NC_019955	TCGA	2	8	3778	3785	25 %	25 %	25 %	25 %	433656325
75	NC_019955	TCA	2	6	3859	3864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656325
76	NC_019955	TGC	2	6	3887	3892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656325
77	NC_019955	TTGA	2	8	3893	3900	25 %	50 %	25 %	0 %	433656325
78	NC_019955	TTG	2	6	3945	3950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656325
79	NC_019955	AAGA	2	8	3958	3965	75 %	0 %	25 %	0 %	433656325
80	NC_019955	AAC	2	6	4280	4285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
81	NC_019955	GC	3	6	4314	4319	0 %	0 %	50 %	50 %	433656326
82	NC_019955	TTC	2	6	4322	4327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656326
83	NC_019955	CAA	2	6	4335	4340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656326
84	NC_019955	TTTG	2	8	4345	4352	0 %	75 %	25 %	0 %	433656326
85	NC_019955	CGAC	2	8	4409	4416	25 %	0 %	25 %	50 %	433656326
86	NC_019955	ATG	2	6	4487	4492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656326
87	NC_019955	ATT	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	433656327
88	NC_019955	GC	3	6	4619	4624	0 %	0 %	50 %	50 %	433656327
89	NC_019955	ACG	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656327
90	NC_019955	T	6	6	5010	5015	0 %	100 %	0 %	0 %	433656328
91	NC_019955	CGA	2	6	5066	5071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656328
92	NC_019955	CTT	2	6	5108	5113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
93	NC_019955	GT	3	6	5130	5135	0 %	50 %	50 %	0 %	433656328
94	NC_019955	ACC	2	6	5137	5142	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
95	NC_019955	CTT	2	6	5169	5174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
96	NC_019955	GA	3	6	5182	5187	50 %	0 %	50 %	0 %	433656328
97	NC_019955	TCA	2	6	5227	5232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
98	NC_019955	GCT	3	9	5282	5290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
99	NC_019955	CCA	2	6	5293	5298	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656328
100	NC_019955	ATC	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
101	NC_019955	CTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
102	NC_019955	TTC	2	6	5383	5388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656328
103	NC_019955	CACG	2	8	5393	5400	25 %	0 %	25 %	50 %	433656328
104	NC_019955	AAAC	2	8	5465	5472	75 %	0 %	0 %	25 %	433656328
105	NC_019955	GTC	2	6	5535	5540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
106	NC_019955	TCG	2	6	5557	5562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656328
107	NC_019955	GAT	2	6	5631	5636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656328
108	NC_019955	ATC	2	6	5716	5721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656328
109	NC_019955	GTAC	2	8	5722	5729	25 %	25 %	25 %	25 %	433656329
110	NC_019955	CAC	3	9	5777	5785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
111	NC_019955	AGT	2	6	5923	5928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
112	NC_019955	TCA	2	6	5929	5934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656329
113	NC_019955	CCGA	2	8	6003	6010	25 %	0 %	25 %	50 %	433656329
114	NC_019955	GAT	2	6	6044	6049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656329
115	NC_019955	GCA	2	6	6051	6056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
116	NC_019955	CCA	2	6	6130	6135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433656329
117	NC_019955	TAA	2	6	6162	6167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656329
118	NC_019955	GAA	2	6	6203	6208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656329
119	NC_019955	GCA	2	6	6352	6357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656329
120	NC_019955	AAATC	2	10	6375	6384	60 %	20 %	0 %	20 %	433656329
121	NC_019955	CCAG	2	8	6668	6675	25 %	0 %	25 %	50 %	433656330
122	NC_019955	CAT	2	6	6759	6764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656330
123	NC_019955	GTA	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656330
124	NC_019955	GC	3	6	6924	6929	0 %	0 %	50 %	50 %	433656330
125	NC_019955	CAAA	2	8	7032	7039	75 %	0 %	0 %	25 %	433656330
126	NC_019955	ATA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656330
127	NC_019955	TG	3	6	7512	7517	0 %	50 %	50 %	0 %	433656331
128	NC_019955	GT	3	6	7535	7540	0 %	50 %	50 %	0 %	433656331
129	NC_019955	AAT	2	6	7562	7567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	433656331
130	NC_019955	TCG	2	6	7597	7602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656331
131	NC_019955	GCA	2	6	7712	7717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
132	NC_019955	AAG	2	6	7723	7728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
133	NC_019955	CGG	2	6	7963	7968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
134	NC_019955	GAC	2	6	8037	8042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
135	NC_019955	ATCA	2	8	8061	8068	50 %	25 %	0 %	25 %	433656332
136	NC_019955	GCG	2	6	8142	8147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433656332
137	NC_019955	AGC	2	6	8171	8176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656332
138	NC_019955	GGT	2	6	8199	8204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
139	NC_019955	AAC	2	6	8259	8264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656332
140	NC_019955	GTG	2	6	8277	8282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
141	NC_019955	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
142	NC_019955	CTA	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
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144	NC_019955	AAG	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656332
145	NC_019955	TTC	2	6	8433	8438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656332
146	NC_019955	TTG	2	6	8454	8459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656332
147	NC_019955	ATC	2	6	8475	8480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
148	NC_019955	TTGG	2	8	8542	8549	0 %	50 %	50 %	0 %	433656332
149	NC_019955	GCC	2	6	8570	8575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
150	NC_019955	TGA	2	6	8602	8607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656332
151	NC_019955	GCC	2	6	8737	8742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433656332
152	NC_019955	TTCG	2	8	8757	8764	0 %	50 %	25 %	25 %	433656332
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155	NC_019955	TAC	2	6	8841	8846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656332
156	NC_019955	CTG	2	6	8865	8870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
157	NC_019955	CGT	2	6	8877	8882	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656332
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159	NC_019955	TGG	2	6	8972	8977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656332
160	NC_019955	TGCA	2	8	8998	9005	25 %	25 %	25 %	25 %	433656332
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163	NC_019955	TCT	2	6	9081	9086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656332
164	NC_019955	ACA	2	6	9194	9199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656333
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168	NC_019955	TGAAGT	2	12	9524	9535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656333
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172	NC_019955	ATC	2	6	9729	9734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656333
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174	NC_019955	CGTG	2	8	9818	9825	0 %	25 %	50 %	25 %	433656333
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241	NC_019955	CAT	4	12	12834	12845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656335
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245	NC_019955	CATTGG	2	12	13031	13042	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	433656335
246	NC_019955	CAA	2	6	13111	13116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656335
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252	NC_019955	ATC	2	6	13348	13353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656335
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255	NC_019955	AGA	2	6	13461	13466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	433656335
256	NC_019955	GTG	2	6	13484	13489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656335
257	NC_019955	TGGT	2	8	13531	13538	0 %	50 %	50 %	0 %	433656335
258	NC_019955	ATG	2	6	13642	13647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656335
259	NC_019955	TCG	2	6	13719	13724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656335
260	NC_019955	TGG	2	6	14167	14172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433656336
261	NC_019955	ATCA	2	8	14195	14202	50 %	25 %	0 %	25 %	433656336
262	NC_019955	TTG	2	6	14401	14406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656336
263	NC_019955	GCT	2	6	14456	14461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656336
264	NC_019955	TCAT	2	8	14477	14484	25 %	50 %	0 %	25 %	433656336
265	NC_019955	GT	3	6	14506	14511	0 %	50 %	50 %	0 %	433656336
266	NC_019955	TATGT	2	10	14517	14526	20 %	60 %	20 %	0 %	433656336
267	NC_019955	A	6	6	14554	14559	100 %	0 %	0 %	0 %	433656337
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271	NC_019955	A	6	6	15153	15158	100 %	0 %	0 %	0 %	433656338
272	NC_019955	ACA	2	6	15182	15187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656338
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274	NC_019955	CAA	2	6	15483	15488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433656338
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276	NC_019955	CTT	2	6	15619	15624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656339
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282	NC_019955	TC	3	6	15857	15862	0 %	50 %	0 %	50 %	433656339
283	NC_019955	TGT	2	6	15876	15881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656339
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285	NC_019955	GAT	2	6	15965	15970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656339
286	NC_019955	TGA	2	6	16012	16017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656339
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290	NC_019955	TGT	2	6	16207	16212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433656339
291	NC_019955	CG	3	6	16216	16221	0 %	0 %	50 %	50 %	433656339
292	NC_019955	CTT	2	6	16243	16248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656339
293	NC_019955	GTCA	2	8	16250	16257	25 %	25 %	25 %	25 %	433656339
294	NC_019955	GTTGG	2	10	16269	16278	0 %	40 %	60 %	0 %	433656339
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301	NC_019955	GAGC	2	8	16591	16598	25 %	0 %	50 %	25 %	433656339
302	NC_019955	CAT	2	6	16630	16635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656339
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350	NC_019955	CCATTA	2	12	19461	19472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656341
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352	NC_019955	AGCT	2	8	19510	19517	25 %	25 %	25 %	25 %	433656341
353	NC_019955	CTT	2	6	19527	19532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
354	NC_019955	TCT	2	6	19610	19615	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
355	NC_019955	TCT	2	6	19637	19642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
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367	NC_019955	CTT	2	6	20157	20162	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
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369	NC_019955	TAG	2	6	20257	20262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656341
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371	NC_019955	GTA	2	6	20538	20543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656341
372	NC_019955	CTT	2	6	20545	20550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
373	NC_019955	CTT	2	6	20631	20636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
374	NC_019955	ACT	2	6	20654	20659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656341
375	NC_019955	CTT	2	6	20682	20687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
376	NC_019955	CTA	2	6	20688	20693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433656341
377	NC_019955	TCT	2	6	20699	20704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
378	NC_019955	CTG	3	9	20724	20732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
379	NC_019955	GAT	2	6	20755	20760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433656341
380	NC_019955	CAG	2	6	20826	20831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433656341
381	NC_019955	CGGA	2	8	20953	20960	25 %	0 %	50 %	25 %	433656341
382	NC_019955	TAGG	2	8	21003	21010	25 %	25 %	50 %	0 %	433656341
383	NC_019955	GTTG	2	8	21053	21060	0 %	50 %	50 %	0 %	433656341
384	NC_019955	CTT	2	6	21069	21074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433656341
385	NC_019955	GCT	2	6	21161	21166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
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387	NC_019955	GACT	2	8	21236	21243	25 %	25 %	25 %	25 %	433656341
388	NC_019955	TGC	2	6	21253	21258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433656341
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